なんてことない普通の主人公・いろはが入学したのは、暗号を解いて解いて解きまくる スパルタ学校――暗号学園！ 迫りくる暗号ラッシュに息も絶え絶えのいろはだったが、 そこに凍という謎の人物が現れ、これまた謎の眼鏡を託す。 実はこの眼鏡にはとんでもない謎が秘められており...。