古より、人と怪異との間には和平協定が結ばれている。しかし、小規模なトラブルは後を絶たず、時に被害者が出る事もある。そんな事件に対応するのが、【京都府警陰陽課】である。新人としてそこに配属された紙上結（しがみ ゆい）は、訓練に明け暮れる毎日を過ごしていた。そんなある日、紙上は課長室に呼び出される。近年、凶悪な怪異事件が増加しているため、人間側と怪異側で合同捜査を行う事になったという。そして、なんと新人の紙上に対して、怪異側の「協力者」と共に事件捜査にあたれという特命が下される。それは、風変りなパートナーとの、破天荒な現場捜査の数々の幕開けだった──！